Биоинформатик/научный сотрудник

Центр постгеномных технологий приглашает научного сотрудника-биоинформатика, с уверенным владением Python, опытом в написании научных статей и желанием их писать, а также опытом самостоятельной работы.

Обязанности:

• Основные задачи - в области геномики патогенных микроорганизмов, научная работа.
• Разработка биоинформатических пайплайнов для автоматизации задач по обработке данных секвенирования.
• Сборка и обработка референсных баз данных геномных последовательностей.
• Подбор и тестирование праймерных последовательностей.
• Представление результатов в виде научных статей, написание научных статей.
• Составление отчётной документации.
• Участие в разработке универсальных скрининговых систем.

Требования:

• высшее образование профильное либо в смежной области (биология, молекулярная биология, биотехнология, биоинформатика, генетика и т.п.).
• Опыт написания научных статей - обязательно и желание их писать.
• Опыт обработки данных высокопроизводительного секвенирования.
• Опыт работы с вычислительными кластерами (unix, bash, slurm).
• Плюсом будет опыт работы в молекулярно-генетической лаборатории
• Уверенное владение python:
  • Владение biopython
  • Владение библиотеками для статистической обработки и визуализации данных (pandas, numpy, matplotlib).
  • Знание синтаксиса SQL.
• Умение работать с вычислительными кластерами (unix, bash, slurm)
• Опыт работы с программными пакетами для:
  • картирования прочтений и аннотации вариантов нуклеотидной последовательности (bwa, Samtools, bcftools, GATK);
  • алгоритмов поиска и таксономической классификации.
• Навыки быстрого анализа литературных данных.
• Преимуществом будет владение программными пакетами для:
  • сборки геномов de novo
  • сборки геномов по референсу
  • алгоритмов поиска и таксономической классификации
  • построения попарных и множественных выравниваний последовательностей
  • проведения филогенетического анализа.

Условия:

• оформление по ТК РФ.
• Своевременная выплата заработной платы.
• В начале работы (2-3 месяца) - присутствие в лаборатории каждый день по пятидневной рабочей неделе (время прихода и ухода с работы - по договоренности с непосредственным руководителем) с целью полного погружения в тему и работу лаборатории, далее можно рассмотреть режим работы - 2-3 дня присутственные дни, остальное время - дистанционно (по договоренности с непосредственным руководителем).
• Возможность прикрепления к ведомственной поликлинике.
• Возможность участвовать в научных конференциях, семинарах и обучающих программах.
• Размер заработной платы обсуждается индивидуально, зависит от знаний, опыта, навыков.
• Возможность профессионального роста.
• Современная лаборатория с хорошим оборудованием.
• Научные исследования имеют научно-прикладной характер.