Описание
Компания Plastilin занимается оптимизацией получения новых сортов сельскохозяйственных растений совместно с агрохолдингами. Мы делаем это за счет технологий генетического редактирования, анализа данных генотипирования и автоматизации процессов.
Своей основной целью мы ставим выведение новых линий и сортов растений, которые будут кратно превосходить имеющиеся в урожайности, питательной ценности, устойчивости к изменениям климата и патогенам. Одно из направлений работы – анализ генетической информации о сортах, ее связи с фенотипами, составление рекомендательных схем по ведению селекционного процесса и его автоматизации за счет создания собственной платформы.
Мы ищем в команду биоинформатика с опытом работы с биоинформатическими инструментами, заинтересованного в решении сложных задач в области геномной селекции растений
Обязанности
-
Разработка и внедрение алгоритмов предсказания фенотипов по генотипам и результатов скрещиваний для самоопыляемых и перекрестно-опыляемых культур
-
Поиск и внедрение новых алгоритмов поиска связи генотип-фенотип для сельскохозяйственных культур
-
Анализ данных геномного секвенирования (WGS, GBS, ddRAD, SNPseq)
Требования к кандидату
-
Владение Python, R, bash
-
Опыт анализа NGS данных и написания пайплайнов, понимание принципов работы основных инструментов
-
Опыт работы с серверами на базе Linux
-
Знания в области геномной и маркер-ассоциированной селекции
-
Знание статистики, молекулярной биологии, популяционной генетики
-
Опыт проведения GWAS и интерпретации полученных результатов
-
Понимание работы алгоритмов машинного обучения для анализа биологических данных
-
Свободное владение английским языком для чтения научной литературы и технической документации (уровень B2 или выше)
Плюсом будет
-
Опыт работы с облачными вычислениями (Yandex Cloud, Selectel, AWS ect.)
-
Опыт работы с языками для масштабирования пайплайнов (Snakemake, CWL, Nextflow)
Условия:
-
Гибкий график (20-40 часов в неделю), минимальная нагрузка по документообороту
-
Офис в Москве, в районе метро Киевская/Фрунзенская
-
Социальная защищенность - прозрачные условия трудоустройства, трудоустройство по ТК РФ, фиксированная белая зарплата
